一、實(shí)驗(yàn)室簡(jiǎn)介
PI簡(jiǎn)介
孫開(kāi)元博士于2018年獲得美國(guó)東北大學(xué)物理學(xué)博士學(xué)位，師從復(fù)雜系統(tǒng)與傳染病建模交叉領(lǐng)域的Alessandro Vespignani教授，博士期間專注于多尺度復(fù)雜系統(tǒng)理論及其在傳染病動(dòng)力學(xué)中的應(yīng)用。博士畢業(yè)后，在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院福格提國(guó)際中心（Fogarty International Center）擔(dān)任博士后（導(dǎo)師：Cécile Viboud）及研究科學(xué)家，系統(tǒng)開(kāi)展呼吸道病毒（包括流感病毒、SARS-CoV-2和RSV）的傳播動(dòng)力學(xué)、免疫保護(hù)機(jī)制、跨尺度傳播建模與疫情防控策略研究。其代表性成果發(fā)表于《Science》《Nature Medicine》《Science Translational Medicine》《The Lancet Digital Health》等期刊。孫開(kāi)元博士計(jì)劃于2026年2月加入西湖大學(xué)應(yīng)急醫(yī)學(xué)中心，任研究員、助理教授，并兼聘于西湖大學(xué)交叉科學(xué)中心。
實(shí)驗(yàn)室方向
多尺度宿主-病原動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)室致力于利用數(shù)學(xué)與計(jì)算模型，系統(tǒng)揭示感染性疾病，特別是呼吸道病毒的跨尺度傳播與免疫機(jī)制，搭建從分子、個(gè)體到人群層面的系統(tǒng)建?？蚣?。實(shí)驗(yàn)室結(jié)合數(shù)理建模、流行病學(xué)、生物信息學(xué)與免疫學(xué)的方法，探索病毒進(jìn)化、免疫保護(hù)與疾病傳播之間的動(dòng)態(tài)關(guān)系。
核心研究方向包括：
呼吸道病毒免疫保護(hù)指標(biāo)（Correlates of Protection, CoPs）建模：?結(jié)合血清學(xué)、流行病學(xué)與臨床數(shù)據(jù)，識(shí)別感染與傳播防護(hù)相關(guān)的免疫標(biāo)志物，助力疫苗設(shè)計(jì)與評(píng)估。系統(tǒng)探索免疫記憶、抗原進(jìn)化與免疫印記等復(fù)雜免疫現(xiàn)象的動(dòng)力學(xué)規(guī)律，為新一代疫苗開(kāi)發(fā)提供理論支撐與方法依據(jù)。
跨尺度感染、免疫與傳播動(dòng)力學(xué)機(jī)制研究：構(gòu)建多尺度數(shù)學(xué)與計(jì)算模型，連接個(gè)體內(nèi)病毒復(fù)制與免疫應(yīng)答過(guò)程至人群層面的傳播與演化動(dòng)力學(xué)，解析病原體適應(yīng)性演變、抗原漂移與免疫印記等關(guān)鍵過(guò)程。
疫情干預(yù)策略的建模與人工智能交叉研究：基于高質(zhì)量流行病學(xué)與行為學(xué)數(shù)據(jù)，構(gòu)建數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的動(dòng)態(tài)建模平臺(tái)，系統(tǒng)量化疫苗接種、非藥物干預(yù)、個(gè)體反應(yīng)性行為（reactive behavior）等多因素對(duì)疫情傳播動(dòng)態(tài)的多尺度影響。進(jìn)一步，融合博弈論與多智能體強(qiáng)化學(xué)習(xí)方法，創(chuàng)新探索疫情響應(yīng)策略的智能模擬與自適應(yīng)優(yōu)化，突破傳統(tǒng)建模與決策體系的局限，顯著提升傳染病預(yù)測(cè)、干預(yù)設(shè)計(jì)與資源配置的智能化水平，為公共衛(wèi)生政策制定提供更具前瞻性、科學(xué)性與適應(yīng)性的決策支持。
蛋白質(zhì)語(yǔ)言模型在基因組流行病學(xué)與毒株預(yù)測(cè)中的應(yīng)用：應(yīng)用蛋白質(zhì)語(yǔ)言模型與分子進(jìn)化分析方法，預(yù)測(cè)病毒適應(yīng)性變異，促進(jìn)分子演化機(jī)制與宏觀傳播動(dòng)力學(xué)模型的融合，提升對(duì)病毒傳播與演化趨勢(shì)的前瞻性理解。
傳染病大流行預(yù)警與預(yù)測(cè)平臺(tái)開(kāi)發(fā)：集成流行病學(xué)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)、病原體基因組數(shù)據(jù)與人群行為數(shù)據(jù)，開(kāi)發(fā)動(dòng)態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估與趨勢(shì)預(yù)測(cè)系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)對(duì)潛在大流行病原的早期識(shí)別、傳播動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)及智能預(yù)警，支撐全球健康安全與應(yīng)急響應(yīng)體系建設(shè)。
二、招聘崗位及條件
1.招聘崗位：博士后（2-3名）
2.任職條件：
（1）獨(dú)立開(kāi)展課題研究；
（2）協(xié)助培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)室學(xué)生及科研助理；
（3）撰寫(xiě)研究論文、綜述；
（4）參與基金項(xiàng)目申請(qǐng)以及學(xué)術(shù)交流。
3.要求：
（1）年齡不超過(guò)35周歲；已取得或即將取得博士學(xué)位；
（2）需符合以下至少一個(gè)方向：
方向1（基因組流行病學(xué)）：
具有生物信息學(xué)、基因組學(xué)、流行病學(xué)、微生物學(xué)、計(jì)算生物學(xué)等相關(guān)學(xué)科的研究背景。熟練掌握BEAST、Nextstrain、IQ-TREE等主流分析工具，熟悉病毒序列數(shù)據(jù)庫(kù)（如GISAID、NCBISRA、CNGB等）。
具有以下研究興趣者將優(yōu)先考慮：
1）利用蛋白質(zhì)語(yǔ)言模型進(jìn)行病毒進(jìn)化路徑預(yù)測(cè)；
2）探索將分子流行病學(xué)與傳染病動(dòng)力學(xué)模型融合的方法，以推動(dòng)對(duì)病毒傳播和演化機(jī)制的深入理解。
方向2（理論/計(jì)算免疫學(xué)）：
具有理論物理、應(yīng)用數(shù)學(xué)、計(jì)算生物學(xué)或相關(guān)學(xué)科背景的博士后研究員。需具備定量生物學(xué)建模的研究經(jīng)驗(yàn)，能夠運(yùn)用數(shù)學(xué)模型和計(jì)算方法開(kāi)展免疫系統(tǒng)相關(guān)機(jī)制的探索。
我們優(yōu)先考慮對(duì)以下研究方向感興趣的申請(qǐng)者：
1）利用理論建模揭示機(jī)體針對(duì)病原體的免疫應(yīng)答規(guī)律；
2）構(gòu)建和分析跨尺度的免疫動(dòng)力學(xué)模型，以理解免疫記憶、免疫印跡或群體免疫建立過(guò)程中的關(guān)鍵機(jī)制。
歡迎具備扎實(shí)數(shù)理基礎(chǔ)、對(duì)生物系統(tǒng)建模充滿熱情、并愿意在交叉學(xué)科環(huán)境中開(kāi)展開(kāi)創(chuàng)性研究的博士加入團(tuán)隊(duì)。
三、薪酬待遇
1.根據(jù)個(gè)人科研工作能力提供具有市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力的薪酬，具體面議。實(shí)驗(yàn)室將提供穩(wěn)定的工作環(huán)境與一流的研究平臺(tái)，協(xié)助申報(bào)博士后相關(guān)項(xiàng)目等。
2.學(xué)校可協(xié)助辦理落戶、協(xié)助對(duì)接子女的入學(xué)入托服務(wù)工作。
3.學(xué)校提供全方位培養(yǎng)體系，設(shè)立“西湖大學(xué)優(yōu)秀博士后”“西湖優(yōu)秀女性博士后獎(jiǎng)”等項(xiàng)目。
四、資助政策
1.博士后可享受杭州市在站博士后資助政策。
2.對(duì)獲得中國(guó)博士后科學(xué)基金資助和浙江省博士后擇優(yōu)項(xiàng)目資助的，杭州市給予1:1配套資助。
3.對(duì)出站留杭（來(lái)杭）工作的博士后，杭州市給予每人40萬(wàn)元補(bǔ)助。
4.對(duì)來(lái)杭工作符合條件的全球本科及以上學(xué)歷應(yīng)屆畢業(yè)生（含畢業(yè)5年內(nèi)的回國(guó)留學(xué)人員、外國(guó)人才），杭州市發(fā)放生活補(bǔ)貼，其中博士10萬(wàn)元。
5.可申請(qǐng)認(rèn)定杭州市高層次人才，并享受相應(yīng)政策。
五、應(yīng)聘方式
請(qǐng)將以下材料以PDF形式發(fā)送至sunkaiyuan@westlake.edu.cn郵箱，郵件標(biāo)題請(qǐng)注明：“應(yīng)聘博士后+本人姓名+高校人才網(wǎng)”，對(duì)于符合要求并通過(guò)初審者，將會(huì)通知安排面試。招聘啟事在崗位招滿前有效。【快捷投遞：點(diǎn)擊下方“立即投遞/投遞簡(jiǎn)歷”，即刻進(jìn)行職位報(bào)名】
1.個(gè)人簡(jiǎn)歷；
2.2位同行專家的推薦信；
3.博士學(xué)歷學(xué)位證明材料。
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