中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所（以下簡稱基因組所）成立于2014年，由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院和深圳市政府共同支持建設(shè)，實行理事會管理，探索體制機(jī)制創(chuàng)新，致力于建設(shè)世界一流農(nóng)業(yè)科研院所。
        成立以來，基因組所深入貫徹落實習(xí)近平總書記“四個面向、兩個一流”指示精神，先后開展科研自主權(quán)改革、科技人才分類評價等國家級科技體制改革試點工作，被列為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院現(xiàn)代院所改革的“試驗田”；成立了組學(xué)技術(shù)、合成生物學(xué)、植物基因組、動物基因組、生態(tài)基因組、食品科學(xué)等研究中心和相關(guān)技術(shù)平臺，形成了以多組學(xué)技術(shù)、基因編輯技術(shù)和合成生物學(xué)技術(shù)為基礎(chǔ)，以生物育種和食品健康為方向的“3+2”學(xué)科體系；參與建設(shè)“熱帶作物生物育種全國重點實驗室”，獲批“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心”“農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)基因數(shù)據(jù)分析重點實驗室”等創(chuàng)新載體；在包括 Science、Nature、Cell 等頂級期刊在內(nèi)的雜志上發(fā)表論文1500多篇，以基因組設(shè)計育種育成國審、省審新品種40余個，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)等研究領(lǐng)域占據(jù)世界前沿。2019年以來自然指數(shù)排名全國農(nóng)業(yè)類科研院所前列，多項成果入選“‘十三五’十大農(nóng)業(yè)科技標(biāo)志性成果”“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進(jìn)展”“中國農(nóng)業(yè)農(nóng)村重大新技術(shù)”等，先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎(chǔ)科學(xué)獎”“全國創(chuàng)新爭優(yōu)獎”“深圳經(jīng)濟(jì)特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進(jìn)模范人物”“深圳市市長獎”“廣東省五一勞動獎狀”等獎勵。
       基因組所將立足國家戰(zhàn)略需求和地方經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展需要，致力于農(nóng)業(yè)高水平科技自立自強(qiáng)，打造國際一流的生命科學(xué)和生物農(nóng)業(yè)原始創(chuàng)新引擎。